2026 여수·NH농협컵 남자부는 각 조 상위 두 팀이 준결승에 진출하는 방식으로 진행됐다. 따라서 A조와 B조에서 각각 1·2위를 차지한 네 팀이 준결승 무대에 올랐다.

A조에서는 대한항공이 1위, 현대캐피탈이 2위로 조별리그를 마쳤다. 대한항공은 조별리그에서 2승을 거둬 준결승 진출을 눈앞에 뒀고, 최종적으로 두 팀 모두 다음 단계에 진출했다.
B조는 한국전력이 1위, 우리카드가 2위였다. 준결승은 두 조의 팀이 교차하는 대진으로 편성돼 대한항공-우리카드, 한국전력-현대캐피탈의 맞대결로 확정됐다. 조별리그 순위표에는 승점과 세트득실률·점수득실률이 함께 표시됐지만, 동률일 때 이 항목들을 적용하는 순서는 확인되지 않았다.
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