알파고와 이세돌은 2016년 3월 서울에서 5번기를 치렀다. 알파고가 4승 1패로 이겼으며, 딥마인드는 전 세계 2억 명 넘게 이 대국을 시청했다고 밝혔다. 인간 프로 기사와 인공지능의 대결로 주목받은 이 승리는 전문가들이 예상한 시점보다 10년 앞서 세계 챔피언을 꺾은 성과로 소개됐다.

알파고는 컴퓨터 바둑 프로그램 가운데 처음으로 프로 9단 인증을 받았다. 딥마인드는 9단을 최고 단계의 인증으로 설명했다. 바둑판의 가능한 배치가 10의 170제곱에 이를 만큼 경우의 수가 방대해, 오랜 기간 개발된 컴퓨터 프로그램도 인간 아마추어 수준에 머물렀다.
알파고는 심층 신경망과 탐색 알고리즘을 결합했다. 다음 수를 고르는 신경망과 대국의 승자를 예측하는 신경망을 활용했고, 탐색 알고리즘으로 수를 살피며 대국을 계획했다. 먼저 전문가들의 대국을 학습한 뒤 여러 버전의 자기 자신과 수천 차례 대국하며 실수를 통해 실력을 높였다. 이 방식은 바둑처럼 복잡한 문제에 인공지능을 적용하는 한 방법을 보여줬다.
상징적인 장면은 제2국의 알파고 37수였다. 딥마인드는 인간 프로 기사가 그 수를 둘 가능성이 1만분의 1로 평가됐다고 설명했다. 당시 프로 해설자들이 처음에는 실수로 여겼지만, 알파고는 그 대국에서 이겼고 이 수는 바둑의 오랜 통념을 흔든 장면으로 소개됐다.
제4국에서는 이세돌이 78수를 두어 승리했다. 딥마인드는 이 수 역시 출현 가능성이 1만분의 1이었다고 밝혔다. 제2국의 37수는 알파고의 승리를, 제4국의 78수는 이세돌의 승리를 각각 도왔다. 딥마인드는 알파고의 승리가 신경망과 강화학습을 복잡한 문제에 적용할 가능성을 보여줬다고 평가했다.
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