FUT와 FUE는 이식할 모낭을 공여부에서 얻는 방식이 다르다. FUT는 두피를 띠 모양으로 절제한 뒤 모낭을 분리하고, FUE는 모낭을 하나씩 채취한다.

채취 방식의 차이는 흉터 형태에도 이어진다. FUT는 긴 선형 흉터가 남을 수 있고, 수술 뒤 첫 주 동안 절개 부위에 통증이나 불편감이 있을 수 있다. FUE는 개별 채취 흔적이 남으며, 삭발한 경우 그 흔적이 2~3주간 보일 수 있다.
FUT가 적합한지는 두피 탄력 등을 살펴 판단한다. 공여부 전체의 모발이 얇아진 경우에는 FUT뿐 아니라 모발이식 자체가 적합하지 않을 수 있다. 따라서 두 방식 중 하나를 선택하기 전에 공여부 상태와 수술 적합성을 확인해야 한다.
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