마인크래프트 서버를 직접 운영하려면 먼저 플레이할 에디션을 구분해야 한다. Java Edition용 공식 서버 소프트웨어는 무료로 내려받을 수 있고, Bedrock Dedicated Server는 Bedrock Edition을 위한 공식 소프트웨어로 크로스플랫폼 플레이를 지원한다.

두 서버는 이름만 다른 같은 설치 파일이 아니라, 각각 Java Edition과 Bedrock Edition을 대상으로 구분된 공식 소프트웨어다. 따라서 서버를 고를 때의 첫 판단 기준은 어떤 에디션에서 접속할 것인지다.
여러 플랫폼 이용자가 한 서버에서 플레이하는 구성이 필요하다면, 공개된 정보상 크로스플랫폼 지원이 명시된 쪽은 Bedrock Dedicated Server다. 반면 Java Edition 서버 자료에는 무료 다운로드 제공 사실이 확인돼 있다.
이 차이는 서버의 운영 목적을 가르는 핵심 포인트다. Java Edition 중심이라면 Java 서버 소프트웨어를, Bedrock Edition에서 플랫폼을 넘는 함께 플레이가 중요하다면 Bedrock Dedicated Server를 확인하는 방식으로 구분할 수 있다. 다만 제공된 내용만으로는 각 소프트웨어의 세부 설정 방식이나 추가 기능 차이까지는 확인되지 않는다.
마인플랫폼 고객센터는 마인크래프트 서버 등록과 조직 관리를 지원한다고 안내한다. 이는 공식 Java 서버 소프트웨어와 Bedrock Dedicated Server의 에디션별 구분, 크로스플랫폼 지원 여부와는 별개의 지원 범위로 볼 수 있다.
서버 소프트웨어를 선택하는 단계에서는 에디션과 크로스플랫폼 필요 여부를 먼저 확인하고, 등록이나 조직 관리가 필요한 경우에는 해당 지원 서비스의 안내를 따로 살펴보는 구성이 가능하다.